Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sumo3Q9Z172 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms