Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms