Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stxbp4Q9WV89 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stxbp4Q9WV89 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms