Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nfe2l3Q9WTM4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms