Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cry2Q9R194 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms