Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nphs1Q9QZS7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nphs1Q9QZS7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nphs1Q9QZS7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nphs1Q9QZS7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nphs1Q9QZS7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nphs1Q9QZS7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nphs1Q9QZS7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nphs1Q9QZS7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nphs1Q9QZS7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms