Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolkQ9QUG2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolkQ9QUG2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms