Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim2Q9ESN6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms