Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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