Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snap29Q9ERB0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms