Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgshQ9EQ08 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms