Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Syde1Q9DBZ9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syde1Q9DBZ9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Syde1Q9DBZ9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Syde1Q9DBZ9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syde1Q9DBZ9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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