Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8N1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D8N1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms