Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q9D8L0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q9D8L0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms