Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb4aQ9D6F9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb4aQ9D6F9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms