Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip1Q9D620 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip1Q9D620 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms