Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gcc1Q9D4H2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gcc1Q9D4H2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms