Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk1aQ9D132 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Upk1aQ9D132 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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