Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Polr3eQ9CZT4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Polr3eQ9CZT4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms