Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms