Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms