Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms