Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl11Q9CQF0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms