Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RTRAFQ9CQE8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms