Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp2Q9CQ73 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms