Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Commd4Q9CQ02 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms