Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Prpf8Q99PV0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms