Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2a1Q99PM3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf2a1Q99PM3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms