Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprtQ99M80 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprtQ99M80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms