Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gdpd3Q99LY2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdpd3Q99LY2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms