Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms