Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GatbQ99JT1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms