Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl1Q99J56 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl1Q99J56 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms