Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc39cQ8VE09 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms