Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rdh10Q8VCH7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rdh10Q8VCH7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rdh10Q8VCH7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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