Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BbxQ8VBW5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms