Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ApobrQ8VBT6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobrQ8VBT6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms