Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc12Q8R344 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms