Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccm2Q8K2Y9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccm2Q8K2Y9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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