Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud6bQ8K2H2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms