Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Csnka2ipQ8CH19 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Csnka2ipQ8CH19 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Csnka2ipQ8CH19 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms