Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGI1

Fam193a, Protein FAM193A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193aQ8CGI1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam193aQ8CGI1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms