Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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