Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc28aQ8CEI3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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