Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup88Q8CEC0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms