Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
9030612E09RikQ8CE20 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms