Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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