Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccser1Q8C0C4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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