Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Pggt1bQ8BUY9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
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Pggt1bQ8BUY9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Pggt1bQ8BUY9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pggt1bQ8BUY9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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