Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcgF3Q8BTQ0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms